验证结构基因全长,判断是否是断裂基因已测序获得酵母结构基因A的3’端86个核苷酸序列和5’端54个核苷酸序列信息.设计一个完整实验来确证酵母菌结构基因A有多大?这个结构基因A是否是断

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/04 10:39:41
验证结构基因全长,判断是否是断裂基因已测序获得酵母结构基因A的3’端86个核苷酸序列和5’端54个核苷酸序列信息.设计一个完整实验来确证酵母菌结构基因A有多大?这个结构基因A是否是断

验证结构基因全长,判断是否是断裂基因已测序获得酵母结构基因A的3’端86个核苷酸序列和5’端54个核苷酸序列信息.设计一个完整实验来确证酵母菌结构基因A有多大?这个结构基因A是否是断
验证结构基因全长,判断是否是断裂基因
已测序获得酵母结构基因A的3’端86个核苷酸序列和5’端54个核苷酸序列信息.设计一个完整实验来确证酵母菌结构基因A有多大?这个结构基因A是否是断裂基因?

验证结构基因全长,判断是否是断裂基因已测序获得酵母结构基因A的3’端86个核苷酸序列和5’端54个核苷酸序列信息.设计一个完整实验来确证酵母菌结构基因A有多大?这个结构基因A是否是断
有点看不太懂你的问题,按照我认为得你的意思回答.
1.设计引物(因为你知道5‘ and 3’的序列)
2.PCR
3.Sequencing,然后就知道基因有多大.
4.把你的PCR序列放到ncbi上和你的基因序列比较,就知道有没有不一样(断裂?).

有点看不太懂你的问题,按照我认为得你的意思回答。
1.设计引物(因为你知道5‘ and 3’的序列)
2.PCR
3.Sequencing,然后就知道基因有多大。
4.把你的PCR序列放到ncbi上和你的基因序列比较,就知道有没有不一样(断裂?)。PCR后测序,不直接先测序? 我的基因序列未知,就知道末端,PCR序列怎么比对?这是你自己发现的基因吗?不是的,老师问的...

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有点看不太懂你的问题,按照我认为得你的意思回答。
1.设计引物(因为你知道5‘ and 3’的序列)
2.PCR
3.Sequencing,然后就知道基因有多大。
4.把你的PCR序列放到ncbi上和你的基因序列比较,就知道有没有不一样(断裂?)。

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酵母的基因组数据NCBI里应该有吧,把你用两端引物扩出的序列测序用于测序,测序结果跟数据库里blast一下,就能知道这基因的大致信息了,比如大小,在哪个bac上。
至于是否为断裂基因,你知道基因的序列后,用软件大致分析下,看看orf是怎样的,如果orf是断裂的,你就从预测的内含子两侧设计引物,对DNA和cDNA分别扩增,若是扩出的片段长度有差异就能说明这基因死断裂基因了...

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酵母的基因组数据NCBI里应该有吧,把你用两端引物扩出的序列测序用于测序,测序结果跟数据库里blast一下,就能知道这基因的大致信息了,比如大小,在哪个bac上。
至于是否为断裂基因,你知道基因的序列后,用软件大致分析下,看看orf是怎样的,如果orf是断裂的,你就从预测的内含子两侧设计引物,对DNA和cDNA分别扩增,若是扩出的片段长度有差异就能说明这基因死断裂基因了

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